霉菌一直是保鲜行业最大的敌人，是引起储物腐败变质的最主要原因。臭氧发生器产生的臭氧具有杀菌力强、杀菌谱广、可自行分解不产生残留污染等优点，对霉菌的杀灭效率极高。另一方面，臭氧气体可快速分解物质呼吸排出的乙烯气体，乙烯是催熟剂，会增强呼吸，加速成熟过程。乙烯被分解后降低了新陈代谢，减慢了生理老化进程，因而实现了保鲜作用。臭氧发生器产生的臭氧保鲜的物质出库后保鲜时间长于一般仓库保鲜的物质，同时臭氧还可以去除库内异味。
随着我国臭氧发生器制造技术的发展和完善，臭氧以其杀菌效果好、不产生二次污染、使用方便等优点也在我国的仓储保鲜、消毒灭菌领域中得到越来越广泛的应用。许多院校和研究所还在不断试验它在不同水果、食品储藏中的使用方法。
臭氧发生器产生的臭氧的杀虫菌能力很强，臭氧正是靠其强氧化作用达到杀灭微生物的目的。他与微生物细胞中的多种成分产生反应，从而产生不可逆转的变化。一般认为，先作用与微生物的细胞膜，使膜构成成分受到损伤，导致新陈代谢障碍并抑制其生长，臭氧继续渗透破坏膜内组织，直至杀死。湿度增加能提高杀虫菌力，由于高湿度下微生物细胞膜变薄，其组织容易被臭氧破坏。采用臭氧杀菌的优点是：臭氧的最终产物是氧气，因此无公害；存储物上不会有残留物，对食品没有影响；成本低；用紫外线杀菌，其背阴部没有效果，而臭氧对整个空间都有杀虫菌效果。
